Alors que les fonctionnalités des amiibo pour le prochain Metroid ont été dévoilées il y a peu, une polémique est apparu du fait que le mode difficile était présent dans les fonctions des figurines Nintendo.
Cependant, ces derniers démentent la polémique en affirmant à IGN qu’un mode difficile fera partie intégrante du jeu; en ayant fini le mode normal de celui-ci et que le mode disponible avec les amiibo est un mode nommé « fusion ». Ce mode ne sera optionnel mais pourra débloquer une combinaison fusion une fois finie.
Metroid Samus Returns sortira le 15 septembre 2017 sur 3DS.